海洋少年団活動は少年少女に対して海洋に親しむ機会を与へ海事思想や海洋に関する科学的知識や海上生活に必要な技術の普及につとめると共に団体生活による社会的徳性の涵養、国際交流などの活動を行うことにより国際親善への寄与を目指し、海洋国家日本国の人材育成の一端を担うことを目的としています。

　海洋少年団のミッションは「海に親しむ海洋少年団運動を通じて社会に貢献し、国際性が豊かで各分野でリーダーとして活躍できる人材の育成」と定められています。

　宮古島市は亜熱帯海洋性気候に属し、四方を海に囲まれているため、夏は海から吹いて来る風が暑気を和らげ、冬は島の北側を流れる黒潮が寒気を緩めて冬季でも海洋活動が可能です。海水は沖縄県随一の透明度を誇り、観光名所として人気を集めるビーチや環礁を有する宮古島は海に親しむための環境に恵まれ、海洋少年団の活動する場所に適しています。

　この島に宮古島海洋少年団を設立し、海辺を舞台に島の子供達が海への親しみを育み、団体生活や国際交流活動の体験を通して社会生活に必要な道徳心を養い、宮古島ならではの他には類をみない地域性を最大限に活用し、国や自治体、関係団体、地域住民と連携協力のもと活動を展開することで子供達の健やかな成長と地域のさらなる活性化、発展に寄与するものと考えます。

　宮古島海洋少年団の団員が将来、市や県、国の発展を支えるリーダーとなる人材に成長することも夢ではありません。